ImageJ es un programa de proceso y análisis de imágenes de dominio público (“open source”), realizado en lenguaje Java. Su author, Wayne Rasband trabajaba en el Research Services Branch, National Institute of Mental Health, Bethesda, Maryland, USA. Existen versiones del programa para Windows, Mac y Linux. Con el paso de los años el programa se ha visto complementado por un creciente número de plugins y macros, desarrolladas por un gran número de colaboradores. Estos plugins se pueden añadir a conveniencia al programa original. Toda la información sobre ImageJ se puede encontrar en: http://rsb.info.nih.gov/ij/.

Fiji es una versión de ImageJ más completa con librerias Java 3D y numerosos plugins incorporados. http://fiji.sc

La Unidad de Microscopía Fotónica y Proceso de Imágenes de la Universidad de Oviedo utiliza el programa ImageJ-Fiji como herramienta para proceso y análisis de imágenes obtenidas con los equipos de microscopía confocal e imagen preclínica existentes en la Universidad de Oviedo. Con el fin de facilitar su uso por usuarios no avanzados ha realizado sendos paquetes basados en ImageJ y Fiji para su uso con imágenes de microscopía láser confocal y con imágenes de equipos de preclínica (micropCT, PET-CT y RMN). Los programas realizados son:

ConfocalUniovi ImageJ.

PreclinicaUniovi Fiji.